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L'analyse ADN des bactéries de l'intestin presque achevée

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L'analyse ADN des bactéries de l'intestin presque achevée Empty L'analyse ADN des bactéries de l'intestin presque achevée

Message par Admin Mar 9 Mar - 1:48

Ce travail colossal va permettre de réaliser d'importantes avancées médicales.

«L'ensemble des microbes présents dans le corps humain représente au moins 100 milliards de milliards de cellules, soit dix fois plus que les cellules humaines et près de cent fois plus de gènes que le génome humain. La majorité de ces microbes se trouvent dans notre intestin. Ils jouent un rôle central pour la santé de chacun d'entre nous et la nutrition», soulignent en préambule les cinquante-trois auteurs de l'étude présentant le premier catalogue des séquences génétiques des bactéries intestinales humaines (Nature, 4 mars 2010). Le poids total de la flore intestinale est estimé à environ 1,5 kg chez chaque individu.

Ce travail devrait modifier dans les prochaines années la conception traditionnelle du rôle de l'intestin humain. Ce dernier n'est pas un tube à travers lequel transitent les aliments mais un écosystème microbien, un organe clé dont il nous reste maintenant à comprendre le rôle pour la santé humaine. Non seulement les bactéries nous aident à digérer la nourriture et nous approvisionnent en vitamines et en acides aminés mais elles nous protègent aussi des maladies et façonnent notre système immunitaire.

«Ces nouvelles données génétiques nous permettront de mettre au point des diagnostics et d'affiner des pronostics pour de nombreuses maladies comme l'obésité, le diabète, la maladie de Crohn ou la rectocolite hémorragique. Une connaissance bien plus approfondie de la biologie de l'homme devrait en résulter», assure Dusko Ehrlich, chercheur à l'Inra et coordonnateur du programme européen dans le cadre duquel a été réalisée l'analyse du microbiote intestinal de l'homme (MetaHIT). Lancé en 2008, le consortium regroupe neuf organismes de recherche européens, quatre industriels (dont Danone) et un institut chinois.

«À plus long terme, on pourra essayer de modifier nos populations microbiennes, afin de les optimiser pour favoriser la santé et le bien-être de chacun», poursuit le chercheur . Ces interventions n'auront pas le caractère invasif de la thérapie génique et on peut penser qu'elles seront sans effets secondaires.

Quelques surprises

Ce nouveau catalogue de 3,3 millions de gènes bactériens, que l'on appelle aussi le métagénome de l'intestin humain, est le plus complet jamais réalisé à ce jour. Les chercheurs estiment qu'il doit correspondre à peu près à 80 % de la totalité du métagénome intestinal de l'humanité. Pour y parvenir, ils ont fait appel à une très large diversité de population. Ce métagénome étendu a été réalisé à partir des selles de 124 Danois et Espagnols. Parmi eux, on trouve des personnes en bonne santé aussi bien que des maigres, des obèses ou des personnes atteintes de maladies intestinales inflammatoires.

La plupart des bactéries présentes dans l'intestin sont inconnues et pourraient le rester encore longtemps car on ne sait pas les cultiver en laboratoire. La technique de séquençage à haut débit donne une description très précise des fragments de leur ADN.

Comme le premier séquençage du génome humain, en juin 2000, cette nouvelle avancée a livré quelques surprises. Il y a à la fois une similitude et une forte diversité dans la flore intestinale humaine. «Nous sommes tous différents. C'est comme pour la couleur des yeux ou pour les empreintes digitales, chacun d'entre nous possède une population de microbes intestinaux, une combinaison d'espèces qui lui est très probablement propre», explique Dusko Ehrlich. Près d'un millier d'espèces bactériennes font partie de l'écosystème intestinal humain. Chacun d'entre nous en héberge plus de 150. Près de 75 espèces se retrouvent chez au moins la moitié des gens. Les chercheurs ont comptabilisé pas moins de 16 000 fonctions dans l'ensemble du métagénome.

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